Manuel Antonio on kuuluisa myös luonnon ansiosta. Nauti ulkoilmasta ja kokeile esimerkiksi vaeltamista ja lintubongausta. Sään salliessa Manuel Antonion kansallispuisto ja Nahomi Park -luonnonpuisto sopivat erinomaisesti rennon päivän viettämiseen. Täällä on paljon muutakin nähtävää, kuten Playa La Machan ranta ja Playitasin ranta.